Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms