Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMNB1P20700 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms