Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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PTPRAP18433 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPRAP18433 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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