Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYN1P17600 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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