Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPB42P16452 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPB42P16452 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPB42P16452 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPB42P16452 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPB42P16452 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPB42P16452 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EPB42P16452 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EPB42P16452 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EPB42P16452 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EPB42P16452 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EPB42P16452 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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EPB42P16452 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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EPB42P16452 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPB42P16452 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPB42P16452 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EPB42P16452 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EPB42P16452 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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