Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC007570.1-201ENST00000539987 603 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 IL6-201ENST00000258743 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 AC091614.1-201ENST00000606898 879 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB3P14651 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms