Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PEPDP12955 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PEPDP12955 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PEPDP12955 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PEPDP12955 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PEPDP12955 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PEPDP12955 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PEPDP12955 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PEPDP12955 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PEPDP12955 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PEPDP12955 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PEPDP12955 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PEPDP12955 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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