Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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UBL4AP11441 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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UBL4AP11441 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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UBL4AP11441 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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UBL4AP11441 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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UBL4AP11441 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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UBL4AP11441 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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UBL4AP11441 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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UBL4AP11441 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBL4AP11441 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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UBL4AP11441 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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UBL4AP11441 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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UBL4AP11441 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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UBL4AP11441 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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UBL4AP11441 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBL4AP11441 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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