Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HKR1P10072 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HKR1P10072 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HKR1P10072 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms