Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM58BPP0C7Q3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM58BPP0C7Q3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM58BPP0C7Q3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM58BPP0C7Q3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM58BPP0C7Q3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM58BPP0C7Q3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM58BPP0C7Q3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM58BPP0C7Q3 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM58BPP0C7Q3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM58BPP0C7Q3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM58BPP0C7Q3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM58BPP0C7Q3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM58BPP0C7Q3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM58BPP0C7Q3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM58BPP0C7Q3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM58BPP0C7Q3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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