Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSI1O43347 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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MSI1O43347 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSI1O43347 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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