Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms