Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
O00370 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
O00370 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
O00370 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms