Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QRK9 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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