Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SPANXD-201ENST00000370515 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RNASE11-201ENST00000398008 872 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ALDOAP2-201ENST00000398050 1076 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 IQCF6-201ENST00000398780 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms