Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms