Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF839A8K0R7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF839A8K0R7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms