Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms