Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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