Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms