Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNPO3Q9Y5L0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNPO3Q9Y5L0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNPO3Q9Y5L0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNPO3Q9Y5L0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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