Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R4

NEU2, Sialidase-2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU2Q9Y3R4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEU2Q9Y3R4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms