Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms