Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms