Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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