Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RABGEF1Q9UJ41 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RABGEF1Q9UJ41 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RABGEF1Q9UJ41 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RABGEF1Q9UJ41 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RABGEF1Q9UJ41 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RABGEF1Q9UJ41 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1Q9UJ41 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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