Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms