Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms