Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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CALCOCO1Q9P1Z2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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CALCOCO1Q9P1Z2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCOCO1Q9P1Z2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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