Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SH3BP4Q9P0V3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SH3BP4Q9P0V3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SH3BP4Q9P0V3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SH3BP4Q9P0V3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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