Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms