Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms