Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRDM12Q9H4Q4 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms