Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL25A1Q9BXS0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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COL25A1Q9BXS0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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