Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms