Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP44Q9BS26 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms