Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms