Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOTCH4Q99466 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NOTCH4Q99466 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms