Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT43Q96FT9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms