Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms