Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TMIEQ8NEW7 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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