Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms