Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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