Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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FAM208BQ5VWN6 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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FAM208BQ5VWN6 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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FAM208BQ5VWN6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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FAM208BQ5VWN6 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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FAM208BQ5VWN6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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FAM208BQ5VWN6 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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FAM208BQ5VWN6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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FAM208BQ5VWN6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM208BQ5VWN6 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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