Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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