Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms