Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1066.9 ms