Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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