Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SGCAQ16586 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCAQ16586 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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