Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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